جامعة بنها بدأت كفرع من فروع جامعة الزقازيق منذ عام 1976 بقرار جمهوري رقم 1142 في 25 نوفمبر 1976 قبل أن تستقل عام 2005 . وضمت خمس كليات (الزراعة بمشتهر - الهندسة بشبرا - التجارة والطب والتعليم في بنها).
تأسست كلية الزراعة عام 1911 ، وتعتبر من أقدم كليات الزراعة في مصر.
صدر القرار الوزاري رقم 278 لسنة 1981 بإنشاء كليتي العلوم والآداب ببنها والطب البيطري بمشتهور.
تأسست كلية الحقوق (كفرع لكلية الحقوق بالزقازيق) عام 1990). صدر القرار الوزاري رقم 287 لسنة 1994 بضم كلية الحقوق بفرع بنها.
صدر القرار الوزاري رقم 301 لسنة 1992 بإنشاء المعهد العالي للتمريض ببنها الذي أصبح كلية التمريض عام 1996.
صدر القرار الوزاري رقم 329 في 1 أكتوبر 1998 بإلحاق كلية التربية النوعية بفرع بنها.
صدر القرار الجمهوري رقم 84 لسنة 2005 بفصل فرع بنها عن جامعة الزقازيق لتصبح جامعة بنها.
في 7 مارس 2006 صدر القرار الجمهوري رقم 83 بضم المعهد العالي للتكنولوجيا إلى جامعة بنها.
في 20 يوليو 2006 صدر القرار الجمهوري رقم 267 بإنشاء كلية الحاسبات والمعلومات.
جامعة بنها هي الجامعة الثالثة عشر في التأسيس من بين 17 جامعة. توجد عدة أماكن للحرم الجامعي في بنها ومشتهر وشبرا. تضم الجامعة كليات الطب ، التمريض ، العلوم ، التربية ، التربية البدنية ، التجارة ، الآداب ، القانون ، التربية النوعية ، الحاسبات والمعلومات وكلية الهندسة ببنها ، بالإضافة إلى كليتي الزراعة والطب البيطري في مشتهور والكلية. الهندسة بشبرا. تم تخصيص 180 فدان من الأراضي بمدينة العبور لجامعة بنها لمواجهة التوسع المستقبلي للجامعة. كما تضم جامعة بنها بعض الوحدات الخدمية مثل الإدارة العامة لرعاية الطلاب ، وثلاث مدن جامعية للطلاب في بنها ومشتهر وشبرا بالإضافة إلى مدينتين جامعيتين للطالبات في بنها وشبرا بالإضافة إلى 36 مركزًا ووحدة خدمة الجامعة والمجتمع.