انشئ فرع جامعة اسوان كفرع من فروع جامعة أسيوط في عام 1974  وفي عام 1995 صدر قرار رئيس الجمهورية رقم (23) بإنشاء جامعة جنوب الوادي علي ان يصبح فرع الجامعة تابعا لجامعة جنوب الوادي مع إنشاء ثلاثة كليات هي (الخدمة الاجتماعية - الاداب - الهندسة). وفي عام 2012 صدر قرار رئيس الجمهورية رقم (311) بإنشاء جامعة أسوان كجامعة حكومية مصرية مستقلة وتوالي إنشاء الكليات الجديدة حتى أصبح عدد الكليات 18 كلية بالإضافة إلى معهد التمريض ومعهد البحوث والدراسات الإفريقية ودول حوض النيل. يقع الحرم الرئيسي في مدينه صحارى بأسوان في طريق المطار علي مساحة 400 فدان و يضم 8 كليات حتى الآن، هي كليات: هندسة الطاقة والزراعة والتربية الرياضية والعلوم وطب بيطري والتربية الرياضية والخدمة الإجتماعية كما يضم المبني الإداري الجديد واستاد جامعة أسوان الرياضي ومجموعة الملاعب الرياضية متعددة الاغراض وحمام سباحة الأولمبي وملاعب الكرة الشاطئية و معامل كلية العلوم والجراج الجديد وورش الصيانة للسيارات بالجامعة والمسرح الصيفي والشتوي وساعة الجامعة. يقع الحرم الجديد للجامعة في الحي الثالث بمدينة أسوان الجديدة علي مساحة 98.5 فدان و يضم 9 مباني تحتوي كلية الآداب والحقوق ودار العلوم والتمريض والطب والسياحة والفنادق والألسن والاثار والتجارة وطب الأسنان والمنشآت الطبية الجامعية والمراكز الطبية المتخصصة بأسوان الجديدة والتي جاري تنفيذها. ويضم أيضا مجمع المدرجات الأول والثانى حيث أقيم كل مدرج على مساحة 3 آلاف متر مسطح ويضم دور أرضى وأول ويستوعب كل منهما 700 طالب وطالبة ومجهز بأحدث الأنظمة التكنولوجية في الصوتيات والإضاءة. المدن الجامعية لجامعة أسوان عددها 5 مدن جامعية، منها 3 للبنات و2 للبنين وتستقبل المدن الجامعية نحو 3 آلاف طالب وطالبة فيما تستوعب نحو 12.5 % من عدد طلاب الجامعة. حصدت جامعة أسوان تصنيفا متقدما في تصنيف (THE) علي مستوي الجامعات العربية حيث احرزت جامعة أسوان مركزا متقدما ضمن أفضل عشرة جامعات عربية